StarLighter 翻译组测序建库试剂盒

StarLighter 翻译组测序建库试剂盒

StarLighter Ribosome Profiling Library Kit 是一款基于核糖体印迹测序（Ribo-seq）的高分辨率翻译组测序建库试剂盒，通过精准捕获翻译延伸中的核糖体-mRNA复合物，获取核糖体保护片段（RPFs），解析翻译动态、开放阅读框（ORF）及新生肽链信息等。启衡星生物通过技术优化，实现高效特异性的去除 rRNA，提高对目的 RNA  的检测灵敏度 ，测序数据中rRNA  占比降至平均 14%，最低达到  5%。本试剂盒适用多种哺乳动物，用于翻译调控、发现新 ORF  或探索药物对翻译的影响等研究。

试剂盒信息

* 需额外购买或自备 RNA-seq 建库试剂盒

实验流程

应用场景
1. 了解转录本上的核糖体分布、翻译活性
2. 推测翻译起始位点、ORF 位置
3. 确定蛋白翻译效率
4. 探究翻译调控和基因表达情况
5. 鉴定新蛋白/ 新短肽


研究方向
1. 癌症研究：异常翻译调控；肿瘤特异性抗原识别；治疗抗性研究
2. 疾病机制研究：翻译效率异常分析；非经典翻译区域发现
3. 药物开发与评估：挖掘靶点；脱靶效应检测；药物作用机制研究


 实测数据

1. Cancer Commun：NAT10 介导的 ac4C 修饰通过 eEF2促进 HMGB2翻译驱动肝癌进展

    (DOI: 10.1002/cac2.12595)

这篇文章为了探究  ac4C   修饰及其相关乙酰转移酶  NAT10   在肝细胞癌（HCC）中的功能机制，并寻找潜在治疗靶点。研究使用 Ribo-seq 分析了 NAT10 敲除对 mRNA 翻译效率的影响，发现 NAT10 缺失导致 ac4C 修饰的 mRNA 翻译效率显著降低，尤其是 HMGB2 mRNA 的核糖体结合减少，但 mRNA 水平不变。结果揭示了 NAT10 通过 ac4C 修饰增强HMGB2翻译的机制，并鉴定 eEF2 作为 ac4C 的 " 阅读器 " 直接结合修饰位点促进翻译延伸。

2. Cancer Cell：靶向m6A阅读蛋白 IGF2BP2 通过调控谷氨酰胺代谢抑制急性髓系白血病

    (DOI: 10.1016/j.ccell.2022.10.004)

这篇文章旨在探究 m6A  阅读蛋白 IGF2BP2 在急性髓系白血病（AML）中的致癌作用及其调控机制，重点关注其对谷氨酰胺代谢的调控，并开发靶向 IGF2BP2 的小分子抑制剂作为潜在治疗策略。其中使用 Ribo-seq 分析了 IGF2BP2 敲除对AML 细胞中全局翻译效率（TE）的影响，并检测了 IGF2BP2 靶基因的 RPF 和 mRNA 表达水平，验证 IGF2BP2 是否通过促进翻译调控这些基因。