2 × StarLighter HiFi Ready Mix 是即用型预混液 , 含有定向进化的高保真酶 StarLighter High-Fidelity DNA Polymerase ,其保真度是普通 Taq 酶的 70 倍,扩增速度是 Pfu 的 5 倍。2 × StarLighter HiFi Ready Mix 中添加了独特的延伸因子和特异性促进因子,使其在长片段扩增能力、扩增特异性以及扩增产量方面得到了很大提升。使用 λDNA 、质粒等简单模板时,2 × StarLighter HiFi Ready Mix 可以轻松扩增长达 20 kb 的片段; 而使用基因组 DNA 等复杂模板时,2 × StarLighter HiFi Ready Mix 能有效扩增长达 12 kb 的片 段。 此 外,2 × StarLighter HiFi Ready Mix 对 PCR 抑制剂具有良好的耐受能力,对粗提样本也能进行很好的扩增。
FS-P2301-01、FS-P2301-02、FS-P2301-03
产品组分
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组分名称 |
FS-P2301-01 |
FS-P2301-02 |
FS-P2301-03 |
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2 × StarLighter HiFi Ready Mix |
1 mL |
5 mL |
5 mL*2 |
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StarLighter PCR Enhancer |
200 μL |
1 mL |
1 mL*2 |
储存及运输条件
-25 ~ - 15℃ 保存 ,< 0℃ 运输。
产品应用
使用简单 , 只需加入模板、 引物、 水即可使用;
保真度为普通 Taq 酶的 70 倍;
可以扩增长片段。
注意事项
1. 请不要使用含尿嘧啶的引物和模板。
2. 2 × StarLighterHiFiReady Mix 具有较强的校正活性 ,产生的扩增产物是平末端 ,如果用于下一步克隆实验 ,建议使用平末端克隆。 如果扩增产物需要用于 TA 克隆 ,加 A 之前须先进行 DNA 纯化。
3. 为了提高扩增成功率和产量,请使用高质量的模板。
实验流程
1. 反应体系
1.1. 根据下表推荐,依次加入以下组分:
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组分名称 |
使用量 |
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2 × StarLighter HiFi Ready Mix |
25 μL |
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PCR Enhancer(可选) |
20μL |
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上游引物 (10 μM) |
1μL |
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下游引物 (10 μM) |
1μL |
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模板 |
As Required |
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ddH2O |
Up to 50μL |
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总体积 |
50μL |
a. 模板推荐使用量:基因组DNA(10 ~200ng);质粒活病毒DNA(10pg~50ng);cDNA(1~5μL,不超过反应总体积 1/10);粗品(1~5μL,不超过反应总体积 1/10)。
b. 当扩增片段 GC含量 >60% 且优化条件也无法正常扩增时,推荐使用 PCR Enhancer 来优化 PCR 反应。程序推荐:Touchdown PCR (降落 PCR)程序。
c. 引物反应终浓度可以在 0.1~ 1 μM 之间调整。
1.2. 轻柔吹打混匀后,短暂离心;
2. 推荐反应条件
2.1. 三步法:反应程序参考下表设置;
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步骤 |
温度 |
时间 |
循环数 |
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预变性 a |
95℃ |
3~5min |
1 Cycle |
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变性 |
95℃ |
10 sec |
30 ~ 35 Cycles |
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退火 b |
55~72℃ |
15 sec |
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延伸 c |
72℃ |
30 sec/kb |
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终延伸 |
72℃ |
5min |
1 Cycle |
a. 对于普通模板,预变性可缩短至 30~60 sec;对于复杂模板,例如高GC 序列,推荐延长预变性时间到 3~5 min 以充分变性;大肠杆菌菌落 PCR:建议将预变性调整 10 min,无需预裂解即可高效扩增;酵母菌菌落 PCR:无需调整预变性时间,但需要对酵母菌进行预裂解。 建议使用以下预裂解方式:向酵母菌中添加终浓度 20 mM 的 NaOH 后 95℃预裂解 10 min,或将酵母菌使用液氮反复冻融2~5 次;
b. 根据引物 Tm值设置退火温度。如引物 Tm 值 ≥72℃, 可删除退火步骤,直接进行后续的延伸步骤(两步法 PCR)。如果需要,可以建立一个温度梯度寻找引物与模板结合的最适温度。此外,退火温度直接决定扩增特异性。如发现扩增特异性差,可适当提高退火温度;
c. 对于大多数模板,30 sec/kb 即可有效扩增;对于一些复杂模板,可延长延伸时30~60 sec/kb
2.2. 二步法:反应程序参考下表设置;
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步骤 |
温度 |
时间 |
循环数 |
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预变性 |
95℃ |
3~5min |
1 Cycle |
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变性 |
95℃ |
10 sec |
30 ~ 35 Cycles |
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退火&延伸 |
65~68℃ |
30 sec/kb |
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终延伸 |
72℃ |
5min |
1 Cycle |
通常情况下使用两步法和三步法进行 PCR 扩增,性能无显著差异,可以根据操作习惯自行选择 。但对于一些复杂模板(如长片段, Tm 分布不均匀 , 特殊结构模板),可以尝试两步法或者 Touchdown PCR(降落 PCR) 。此外,使用质粒为模板进行点突变时,也建议使用两步法。
2.3. Touchdown PCR(降落 PCR): 反应程序参考下表设置;
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步骤 |
温度 |
时间 |
循环数 |
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预变性 |
95℃ |
3~5min |
1 Cycle |
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变性 |
95℃ |
10 sec |
30 ~ 40 Cycles |
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退火 |
68℃(-0.2℃/cycle) |
15 sec |
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延伸 |
72℃ |
30sec/kb |
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终延伸 |
72℃ |
5min |
1 Cycle |
该程序仅供参考,Touchdown PCR(降落 PCR)有多种程序可灵活调整,请根据实验需求与习惯自行决定是否采用。
常见问题
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问题描述 |
可能原因 |
解决办法 |
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无产物或产物量少 |
引物 |
优化引物设计 |
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退火温度 |
设置退火温度梯度,找到合适的退火温度 |
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引物浓度 |
适当提高引物浓度 |
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延伸时间 |
适当增加延伸时间至 30~60 sec/kb |
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循环数 |
增加循环数至 36~40 个循环 |
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模板纯度 |
使用高纯度模板 |
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模板使用量 |
使用量参照反应体系推荐量调整并适当增加 |
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有杂带或弥散条带 |
引物 |
优化引物设计 |
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退火温度 |
尝试提高退火温度并设置退火温度梯度 |
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引物浓度 |
适当降低引物浓度 |
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循环数 |
减少循环数至 25~30 个循环 |
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模板纯度 |
使用高纯度模板 |
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模板使用量 |
使用量参照反应体系推荐量调整并适当减少 |