分类

STAR-Click新生转录本测序|解锁高分文章新赛道

STAR-Click新生转录本测序技术是一种基于点击化学的创新性方法,能够高效捕获非编码RNA和瞬时RNA,解决传统RNA-Seq技术的捕获盲区和动态缺失问题。该技术广泛适用于基因调控机制研究、疾病生物标志物筛选、药物筛选与机制验证等前沿领域,助力精准医学与系统生物学发展。
Apr 2nd,2025 30 浏览量

1. 背景

近年来,RNA生物学领域迎来爆发式增长,随着表观遗传学和基因调控机制研究的不断深入,非编码RNA(ncRNA)已被证实是基因调控网络的"隐形操盘手"。它们不仅参与细胞命运决策,更与癌症、神经退行性疾病等重大病理机制密切相关。然而传统RNA-Seq技术受限于两大瓶颈:

捕获盲区:依赖poly(A)尾富集策略,导致非编码RNA(lncRNA)、增强子RNA(eRNA)及环状RNA(circRNA)被漏检。  

动态缺失:现有技术难以捕捉半衰期短至数分钟的瞬时RNA(如应激响应转录本)。

新兴的BrU-Seq、NET-Seq等技术虽试图突破桎梏,但,这些方法在实际操作中仍面临显著不足:捕获效率较低、背景噪声较高、文库构建流程复杂且特异性不佳,从而在高复杂度生物体系中表现不尽如人意。

 为克服上述难题,启衡星生物开发了一种基于点击化学反应的创新性新生转录本测序技术,即STAR-Click新生转录本测序技术(STAR-Click nascent transcript sequencing)。该技术通过点击化学反应对新生转录本进行特异性标记和捕获,与高通量测序有机结合,有效解决了非编码RNA和瞬时编码RNA检测难的问题。

2. 为啥推荐新生转录本测序技术

数据稀缺性高:同类研究竞争少,易产出“人无我有”的创新成果;

方法学创新空间大:结合单细胞、空间转录组等技术,可拓展多维研究范式;

高分文章潜力显著:从机制探索到跨学科应用,研究维度多元,更易获得审稿人青睐。

3. 为啥推荐STAR-Click

3.1 超高捕获效率
基于点击化学反应的高效标记策略能够特异性地结合新合成的RNA分子,使低丰度和瞬时性非编码RNA的捕获效率显著提升。

3.2 高特异性和灵敏度
采用特异性标记和去噪策略,有效降低背景噪声,提升数据准确性,使研究者能够更精确地解析新生转录组的动态变化。

3.3 动态监测能力
能够实时监测增强子RNA(eRNA)长链非编码RNA(lncRNA)及瞬时RNA的表达动态,揭示基因调控机制和转录动力学特征。

3.4 广泛适用性
适用于多种生物体系和实验条件,包括哺乳动物细胞系动物模型植物组织样本,为多领域研究提供全面技术支持。

3.5 灵活实验设计
适合多种实验处理,如药物刺激缺氧应激基因敲除信号通路激活物理环境变化(如失重实验),能够动态捕捉转录组变化。

                                                                                                                                                                                                                   实验流程

4. 从机制到转化:五大前沿应用场景

4.1 基因调控机制研究

STAR-Click技术能够解析增强子RNA(eRNA)在基因表达调控中的动态变化,揭示增强子与启动子间的相互作用机制,深入探讨表观遗传调控转录因子结合过程中的时空特异性。

4.2 应激反应与环境适应性研究

缺氧应激热激反应药物处理条件下,STAR-Click技术能够实时监测非编码RNA的动态表达谱,揭示关键调控分子及信号通路的响应机制。例如,在肿瘤微环境中研究缺氧诱导因子(HIF)调控下的lncRNA网络变化。

4.3 疾病生物标志物筛选

能够在肿瘤组织神经退行性疾病模型代谢性疾病研究中,识别具有诊断和预后价值的特异性ncRNA分子,助力于生物标志物筛选分子分型研究

4.4 药物筛选与机制验证

通过对药物处理前后细胞转录组进行动态监测,捕捉药物作用导致的新生非编码RNA表达变化,帮助识别潜在的靶基因及其调控网络,有助于药物靶点发现机制验证

4.5 发育与分化研究

胚胎发育干细胞分化器官再生研究中,STAR-Click技术可用于分析特定发育阶段或分化诱导条件下的转录组变化,揭示发育过程中非编码RNA的动态调控模式。


为回馈广大科研工作者的支持,启衡星生物即日起开放STAR-Click试剂盒免费试用通道

止日期:2025年4月10日

申请条件:需反馈试用报告

发货时间:试用活动结束后10个工作日内发货

名额有限,先到先得!

产品详情咨询/产品试用申请:

010-62149251/15801217100(微信同号)

我们使用 Cookie 来改善您的在线体验。 继续浏览本网站,即表示您同意我们使用 Cookie