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精品推荐 | 单一物种rRNA去除试剂盒(文末有惊喜呀!)

在植物、动物和微生物的总RNA中,核糖体RNA(rRNA)占比超过90%,这在RNA-seq实验中限制了转录组的检测效率和灵敏度。为解决这一问题,启衡星生物开发了SP-ribo-PooLs核糖体RNA去除系列产品,通过精心设计的生物素修饰DNA探针池,高效特异性地结合rRNA,从而获得无偏差的RNA-seq结果。该系列产品适用于多种物种,包括人类、小家鼠、褐家鼠和栗鼠等,探针设计覆盖了细胞质和线粒体中的主要rRNA,避免了低复杂区域和重复序列。实验数据显示,SP-ribo-Pool在去除18S/28S rRNA方面优于或与Illumina的Ribo-Zero Gold试剂盒相当,且在人和小鼠样本中,rRNA去除效率更高约4%。
Oct 10th,2024 436 浏览量

植物、动物以及微生物中总RNA中核糖体RNA(rRNA)的占比可高达90%以上,在RNA-seq中极大的限制转录组的检测效率及灵敏度(如mRNAs)。RNA-seq试验中,高效特异性去除rRNA可节约样本测序量,并有效提高目的RNA的检测灵敏度。

核糖体RNA(rRNA)去除试剂开发专家——启衡星生物开发的SP-ribo-PooLs核糖体RNA去除系列产品经过精心计算及优化设计了高度复杂的生物素修饰的DNA探针池,可高效的、特异性的结合rRNA,获得无偏差的RNA-seq结果。

本期将重点为大家介绍单一物种核糖体RNA(rRNA)去除产品系列~

1、产品简介

单一物种ribo-Pools用于研究已知和不太为人所知的物种(如人、小家鼠、褐家鼠或栗鼠等)。SP-ribo-Pool for Single Species根据物种的rRNA进行精心计算和复杂的设计,探针pool中的探针可均匀的覆盖细胞质中5S、5.8S、18S、28S rRNAs及12S、16S线粒体rRNAs。

其中,探针设计的关键指标包括:

• 满足与全基因组不匹配的标准

• 在最佳杂交温度下所需的GC%范围

• 避免低复杂区域和重复性序列

2、产品优势

SP-ribo-PooLs核糖体RNA去除系列产品优势

3、相关实验数据


rRNA去除样本的安捷伦Bioanalyzer分析结果图

从HeLa 细胞或小鼠胚胎成纤维细胞中提取的总RNA(RIN ≥ 7.5),以1 μg的投入量,分别用人/大鼠/小鼠SP-ribo-Pool及Ribo-Zero Gold (人、小鼠、兔子) 试剂盒(Illumina) 进行 rRNA去除。人/大鼠/小鼠SP-ribo-Pool试剂盒在去除18S/28S核糖体RNA的表现上优于或与Ribo-Zero Gold试剂盒效果相当。人类样本RNA的去除效果与小鼠样本RNA去除的效果相当。


RNA测序显示SP-ribo-Pool比Ribo-Zero Gold试剂盒去除rRNAs更高效。

对于人和小鼠的样本,SP-ribo-Pool试剂盒比 Ribo-Zero Gold的rRNA去除效率高约4%。

核糖体去除试剂盒产品系列

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