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产品推荐|Ribo-seq研究神器-SP-ribo-seq-Pools 核糖体RNA去除试剂盒

Ribo-seq(核糖体测序)是研究翻译调控和疾病的重要技术,通过测序核糖体保护的mRNA片段,揭示基因表达调控细节。它在癌症、代谢疾病和其他疾病研究中广泛应用,如探索癌症中的翻译调控和药物耐药性,以及在代谢疾病中通过功能富集分析发现差异表达基因。Ribo-seq在肌萎缩侧索硬化症(ALS)和额颞叶痴呆(FTD)等疾病中也展示了潜力。该技术高分辨率和高通量,有望成为诊断和治疗多种疾病的重要工具。由于核糖体RNA (rRNA) 在总RNA中占比高,去除rRNA对于提高RNA-seq的检测效率和灵敏度至关重要。启衡星SP-ribo-seq-Pools试剂盒通过生物素修饰DNA探针池高效特异性地去除rRNA,适用于多种生物样本,操作简便,适合自动化和高通量实验,确保实验结果的准确性和重复性,显著提高目标mRNA的检测灵敏度。
Dec 18th,2024 566 浏览量

1、Ribo-seq 技术简介

Ribo-seq(核糖体测序)是一种强大的技术,广泛应用于翻译调控机制的研究,并在疾病研究中发挥重要作用。

通过深度测序核糖体保护的mRNA片段,Ribo-seq能够捕捉特定时间和生理条件下翻译活动的快照,从而揭示基因表达调控的细节。

2、Ribo-seq 的应用领域

Ribo-seq在癌症、代谢疾病及其他疾病领域的研究中都有应用。

癌症研究

在癌症研究中,Ribo-seq被广泛应用于探索翻译调控、药物耐药性、免疫疗法和纳米药物递送等方面,也可用于揭示癌症细胞中异常激活的翻译调控途径,从而为癌症治疗提供新的靶点。例如,它能够揭示特定mRNA的翻译调控,从而增强黑色素瘤细胞的生存和治疗抵抗能力;帮助理解免疫疗法的机制,如吲哚胺2和调节途径等。

代谢相关疾病

在代谢相关疾病中,Ribo-seq通过功能富集分析发现差异表达基因主要富集在多个KEGG途径类别中,包括代谢、遗传信息处理、细胞过程、组织系统和人类疾病等。这表明Ribo-seq在代谢相关疾病的诊断和治疗中可能具有重要作用。

其他疾病研究

此外,Ribo-seq在其他疾病研究中也展示了其潜力。例如,在肌萎缩侧索硬化症(ALS)和额颞叶痴呆(FTD)中,TDP-43被鉴定为一种新型功能的mRNA-specific翻译增强器,通过特定mRNAs的5'UTRs和3'UTR区域来促进翻译。

3、Ribo-seq 的应用前景

Ribo-seq作为一种高分辨率和高通量的技术,为理解RNA调控机制提供了新的视角,并在疾病研究中展现出巨大的潜力。随着技术的进步和数据库的改进,Ribo-seq有望成为诊断和治疗多种疾病的重要工具。


表1 通过Ribo-seq技术在几种疾病中的发现

4、Ribo-seq研究中去除rRNA的意义

核糖体RNA (rRNA) 占总RNA的80-98%,在RNA-seq中极大的限制转录组的检测效率及灵敏度(如mRNAs)。RNA-seq试验中,高效特异性的去除rRNA以节约样本测序量,提高对目的 RNA的检测灵敏度是非常必要的

5、SP-ribo-seq-Pools试剂盒

启衡星SP-ribo-seq-Pools试剂盒是Ribo-seq技术的重要工具,尤其在去除核糖体RNA(rRNA)方面表现出色。

SP-ribo-seq-Pools试剂盒通过设计复杂的生物素修饰DNA探针池,能够高效特异性地结合并去除rRNA,从而减少对目标mRNA的干扰。其产品优势如下:

  1. 适用于多种生物样本,如人、小鼠/大鼠、果蝇和线虫等;

  2. 操作流程简便,可以在60分钟内完成rRNA去除和RNA纯化;

  3. 适合自动化和高通量实验需求;

  4. 其捕获探针覆盖整个rRNA序列,有效去除高丰度和低丰度的rRNA片段,确保了实验结果的准确性和重复性。

在实际应用中,SP-ribo-seq-Pools试剂盒已被证明能够显著提高Ribo-seq实验中目标mRNA的检测灵敏度,减少假阳性数据的产生,从而提高研究的成功率和效率。因此,可以说SP-ribo-seq-Pools试剂盒是Ribo-seq技术的好帮手,为科研人员提供了一套科学、高效、可靠的rRNA去除方案。

6、产品订购列表

PS:启衡星核糖体RNA(rRNA)去除试剂盒概览

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